Есть очень много программ для создания msi-архивов, которые распространяются через групповые политики - это раз. У многих програм в корпоративно-энтерпрайзных версиях есть свои инструменты для удаленной инсталляции, как в частности у нортонантивируса (симантика), нода, прочих других радостей.

Non solum oportet, sed etiam necessese est