Так определяйтесь с поставщиком, да и забирайте у него его версию программы товарного учёта, особенно если бюджет на данном этапе ограничен. Даже если она "заточена" в большей степени на формирование заказа у него, на самом деле это никаких проблем на одной аптеке вам не создаст. А далее уже можно смотреть варианты перехода на что-то другое, особенно при дальнейшем развитии и открытии новых точек.

Давай, до свиданья, да, я - ненормальный
И ты всё равно не поймёшь на прощанье
Я сделаю вот что и ты никогда не умрёшь, до свиданья!